Para além da grande exibição dos italianos, a arbitragem do português Olegário Benquerença não escapou às críticas dos catalães: o terceiro golo da equipa de José Mourinho gerou polémica, com Milito a cabecear para a baliza em posição irregular. O Barça queixou-se ainda de duas decisões do juiz na área do Inter, com destaque para um derrube de Sneijder a Daniel Alves, nos minutos finais, que o árbitro considerou ter sido simulado pelo brasileiro.